西班牙人占据北台湾，对于南部的荷兰人而言，无异于卧榻之旁来了一只猛虎。基隆和淡水是北台湾的两大港口，是中日贸易的最佳联络点，如果被西班牙人占领，他们的舰船可以随时出击荷兰与中国漳州间贸易的船只，倘若一艘商船被捕获，其损失将大于派遣一支远征军占领基隆的全部经费，其经济利益颇丰。于是荷兰人乃下决心驱逐台湾北部的西班牙人。1642年8月21日在爪哇派来的援军支援下，荷兰舰队攻到基隆城外围，经过四天四夜的炮战，西班牙人终于投降。自此西班牙人在北台湾的16年统治结束。荷兰人除了取得台湾部分南部沿海平原的统治权之外，还取得了台湾北部地区的统治权。他们对台湾的殖民统治延续了38年。