在美蒋矛盾冲突中，中国政府清楚地意识到美国逼蒋放弃金马的意图。从10月3日到13日，毛泽东连续主持召开中共中央政治局常委会议，讨论台湾海峡局势。会议决定，为反对美国分离台湾的阴谋，将金、马留在台湾当局手中，更符合双方“一个中国”的共同利益。毛泽东还通过“中间人”给蒋介石传话，对蒋介石抵制美国分离台湾的行动予以高度肯定。毛泽东指出，只要蒋氏父子能抵制美国，我们可以同他合作；我们赞成蒋保住金门、马祖的方针。

    1959年初，美国炮制的一个完整的“一中一台”方案出笼。这个方案与以前美国政府的论调的不同在于，明确承认中华人民共和国，不再以“中华民国”代替中国，而准备让台湾永远“独立”出去。同时，也要蒋介石放弃“反攻大陆”的想法。甚至肯尼迪与尼克松竞选总统的辩论也拿中国台湾“开涮”，利用中国沿海岛屿问题，互相攻击对方。

    蒋介石坚决拒绝美国方案，并密切关注有关台湾地位与命运的美国人之间的“辩论”。他对美国记者考普莱发表谈话，不点名地批评了肯尼迪的观点，坚决地宣称，台湾即使战斗到最后一人，也不放弃沿海岛屿，哪怕美国不予支持也决不改变这一立场。台湾当局“外交部”还发表声明，点名批评了肯尼迪。在美国制造的“两个中国”问题上，蒋介石的态度一向很明确，即坚决反对所谓的“两个中国”。由于海峡两岸的中国人都坚持了“一个中国”的坚定立场，从而使得1960年代美国历届政府所推动的在联合国实现“两个中国”的方案始终未能得逞。蒋介石在维护祖国统一问题上，表现出坚定的立场，也起到了重要的作用。

    蒋氏父子还重拳出击，坚决地反击了“台独”逆流。

    “台独”是美国、日本反华势力策动、支持的产物，它的产生具有复杂的历史、社会和政治的原因，它是一股历史的逆流。蒋氏父子执政期间，国民党对任何“台独”的言行，采取严厉的打击镇压政策，其武器就是将之绳之以法。台湾当局依据“刑法”和“惩治叛乱条例”，以“叛乱罪嫌”或“涉嫌台独”、“破坏国体，窃据国土”以及“颠覆政府”等罪名给“台独”治罪，并以军事法庭审判“台独”案件。典型案例是廖文毅“台独案”、1960年代最具影响的彭明敏“台独”案、1970年代的“台独联盟”案、基督长老教会案等。这对“台独”分子是有力的震慑。

    对于逃亡海外的“台独”分子，台湾当局一律“列注名单”，下达通缉令，并严厉禁止“台独”分子入境返台。“台独联盟”的大小头目、先后流窜海外的“台独”分子200多人均上了“黑名单”。这些人是台湾有关部门重点掌控和“关注”的对象。

    在台湾当局的严厉打击下，“台独联盟”及其一批流亡的“台独”分子，在海内外可谓臭名昭著。一般海外华人、台籍同胞，对之嗤之以鼻，其组织始终发展不起来。在美国的“台独”分子也只能靠蛊惑和欺骗行事，或龟缩一隅，干些恐怖、暗杀等黑社会的勾当。

    从1940年代中期以后到1980年代末，在蒋氏父子治理台湾的四十多年里，对任何“台独”的言行都予以坚决打击，使一小撮“台独”败类在岛内无立锥之地，在海外亦处于穷途末路之境。蒋氏父子反“台独”的立场和行动，坚持了一个中国的立场，维护了中华民族的统一。

    此外，海峡两岸的中国人为维护南沙群岛和钓鱼岛主权，进行了共同的斗争。蒋氏父子在维护中华民族的尊严问题上作出了自己应有的贡献。油尽灯枯蒋介石到台湾后依然过着大陆时期刻板而有规律的生活。据曾当过蒋贴身侍卫的翁元披露，蒋介石一天的工作、生活安排大致是这样的：

    每天早晨6点起床（冬天7点左右）。起床之后，为了不吵醒喜欢晚睡的宋美龄，蒋介石不打开灯，在黑暗中摸出一支钢笔手电，蹑手蹑脚地到盥洗室进行洗漱。

    当蒋介石轻轻带动门把的那一瞬间，在外值班的警卫就知道蒋已经起床，于是按下电铃，告诉当班的贴身副官前来服侍蒋介石。

    洗漱完毕后，蒋介石在阳台上做自编的一套体操，然后唱圣诗。奇怪的是，蒋介石一唱到“天父”或是“圣哉、圣哉”的时候，他都要面朝东方行脱帽礼。唱完圣诗后，蒋介石就回到书房静坐祈祷。静坐祈祷前，先是用毛毯把自己的膝盖盖好，接着给自己上眼药水，他的眼药水是特制的，主要起保健作用。点完眼药水后，蒋介石就开始静坐。每次静坐的时间差不多都是40分钟。