夏皮罗还想通过孟山都公司的转基因种子使公司获得实现可持续发展目标的优势地位，因为这些种子能增加农作物的产量，减少杀虫剂的施用量，还有助于改善世界上处于慢性营养不良状态下的穷人的营养状况。孟山都公司相信，在几年的时间里，美国的农民就会种植大约6　000万英亩的转基因作物。1997年，夏皮罗又设立了一个新的可持续发展部门，以加强内部为未来发现和增加新的业务的力量，这些业务以经济利益驱动的方式来解决全球社会和环境问题。1995—1997年，孟山都公司的股票价格一路飙升，股市中掀起了对农业生物技术类股票的追捧，其市场份额迅速扩大。

　　这些发展使得孟山都公司以极快的速度进入公众视野，在此之前，没有几家公司能做到这一点。夏皮罗对未来农业中生物技术作用的描述，使得公众对此的关注和研究上升到了前所未有的水平。公众的研究和监督也给孟山都公司带来了麻烦，各种批评投向了与夏皮罗的愿景不匹配的公司行为。

　　例如，当孟山都公司试图在欧洲推广转基因种子时，遇到了来自传统农业生产者和环境保护论者的强烈抵制，尽管所有必需的获批文件都表明转基因种子是安全的。孟山都公司的一些管理人员为了确保农场主们不会不按约定在来年继续使用孟山都公司的转基因种子，雇用了私人调查者了解农场主们的情况。这些行为以及其他的一些做法造成了许多有疑问的人不敢与孟山都公司合作，这样一来，孟山都公司真正致力于可持续发展和环境保护性工作的初衷就无法实现。夏皮罗的愿景并未在公司其他人的行动中得到协调一致的贯彻。

　　其他一些利益相关群体，比如发展中国家印度的数以百万计的小农户，在大街上抗议孟山都公司，他们担心孟山都公司会在他们必需的种子上收取专利费用而使其不得不按照国际市场的价格支付。这些农户还担心孟山都公司对这种“终结者”基因（意指种子绝育技术）的专利权使他们不再能从几千年来传统的繁殖技术中获得种子（意指孟山都公司为保护其专利权，会收购他们生产的所有粮食，连种子都不能留下）。

　　遗憾的是，这些声音没能传到孟山都公司决策制定者的耳朵里。公司只是向大的购买者（购买量大的农场主）、规则制定者和美国的消费者集团了解情况。尽管公司可持续发展部门努力获得了其他的许多反馈，决策制定者们还是没有考虑欧洲的消费集团或发展中国家的小农户们的意见，而他们的呼声也是合法的和有说服力的，即使在他们的呼声已经很急迫时，仍然未被考虑。

　　在抗议之声不断高涨的压力之下，孟山都公司并没有以一种更加开放的、有创新精神的面貌出现在公众面前，相反，它变得更加自我保护，并且不得不公开撤销了几个原来的生物技术项目。1999年10月，孟山都公司为其行为公开致歉：“我们对基因工程技术的信心和我们的热情，我想，大家都看到了，也是这样认为的，我们谦虚但确实也很无知”。［24］来自公司外部的支持逐渐消失，到1999年底，公司走上了与制药企业Pharamcia & Upjohn公司商谈合并的道路。这一举动很快结束了夏皮罗在孟山都公司开展公司可持续发展战略的时代。