1908年1月27日，清廷将禹之谟绞死在靖州。罪名是禹“哄堂塞署”，即禹为反对清廷盐捐浮收和提款兴学，率湘乡驻省中学200名学生回湘乡与县衙交涉。

　　在狱中，酷吏金镜蓉审问禹：“你做的是什么事情？”他答：“救国保种！”又问：“如何救法？”答：“杀人放火”。问：“你欲杀谁？”答：“该杀者即杀之。” 临刑前，禹质问金镜蓉：“我为爱国愿意流血，可以将我绞死？”金答：“你辈素讲流血，今日偏不把你流血，何如？”禹爽然大笑：“好！免得污坏我的血。”就义后，家里收到了他在狱中写的《致中国国民书》。书中说：“身虽禁于囹圄，而志自若。躯壳死耳，我志长存！”其遗体始葬青树坪，民国元年公葬于岳麓山。孙中山追赠禹之谟为陆军左将军。另据冯自由《丙午靖州禹之谟之狱》一文载：“就义之先，虽拇指已断，字迹仍端好如恒。死时，指金牧曰：‘我要流血，为何绞之？辜负我满腔心事矣。’观者多为感动。”禹在被捕前，好友曾劝他暂到圣公会避难，他婉言谢绝，他说：“吾辈为国家、为社会死，义也。各国改革，孰不流血？吾当为前驱。”

　　禹之谟，另名志谟，字稽亭。青树坪贻则堂人。12岁时丧母，幼年既学书又学剑，任侠好奇论，被时人称为“提三尺剑，挟一卷书”。最爱读王船山著作，而对科举之学不屑一顾。常对人言：“曾(国藩)、左(宗棠)、彭(玉麟)，胡(林翼)好大喜功，误入歧途，皆由不善读书之过。”

　　 1886年，禹之谟投身清军，历任文书、军需等职。以“随办转运，办事出力”，被奏勅五品翎顶。后回到湖南结识谭嗣同等维新志士。唐才常组织自立军准备起义，禹积极与谋，奔走沪、汉之间。事泄，东渡日本，习纺织工业及化学。归国后，兴办实业。黄兴发起成立华兴会，禹首批加入。禹之谟勇于任事，且具有出色的宣传和组织才能，深得全省工、商、学界拥戴。湖南商会、教育会及学生自治会等组织建立时，均推他主其事。

　　其实，“哄堂塞署”按照清律不至于被定绞刑。其起因是1906年5月光绪三十二年五月，陈天华和姚宏业烈士灵柩返湘时，他首倡“公葬岳麓山，以彰义烈”。长（沙）、善（化）学务处总监俞诰庆事先破坏、阻挠公葬未能得逞，当天傍晚趁学生返城，指挥军警拘捕学生10余人，引起各界愤怒。禹之谟获知俞诰庆爱嫖娼，遂设伏于娼馆附近，当场拿获，并“黥其面，裸其体，拍其照于土娼胯下”，迫使俞诰庆释放被捕学生。关于这件事，杨世骥《辛亥革命前后的湖南史事》称：“民气伸张至此，清政府危，而官绅之富贵不保矣！”毛泽东在《湘江评论》的《本会总记》中认为这是“惊天动地可纪的一桩事”。并进而指出：“这次毕竟将陈、姚葬好，官府也忍气吞声莫可谁何，湖南的士气在这个时候几如中狂发癫。激昂到了极点。”当道官绅对于禹之谟的这些举动“咸为惊异”，认为“非严厉制裁不足以杜绝祸根”，故寻机加罪。